九十年代开始，主流文学领域里出现了“长篇热”。看最快更新小说就来Www.Biquge77.Net稍晚一些，大约在这2000年左右，这股热潮也渗透进了科幻文学界。毕竟长篇才是文学的重武器。在九十年代，虽然也有《生死平衡》、《海底寻亲》（青岛作家赵丹涯创作）等成人文学风格的长篇科幻出版，但绝大部分科幻图书是儿童文学风格。
从2000年开始，一批质量优秀、风格鲜明的作品相继问世，不再是以前寥若晨星，而是成系统地涌现。它们的出版使得中国科幻水平的峰顶大大增高。可以说，目前最出色的中国科幻小说，对外已不逊于世界优秀科幻作品，对内也不亚于主流文学界的优秀作品。
王晋康经过一段时间的酝酿后，又回到创作行列中来。这次，他以长篇为主，几年中推出了一批长篇力作，包括《拉格朗日墓场》、《少年闪电侠》、《死亡大奖》、《寻找中国龙》等等。王晋康长期专注于生命题材，围绕着“人性被科技改造”这个主题创作了大量作品。2003年，河南人民出版社出版了他的《癌人》、《豹人》、《海豚人》，作家出版社出版了《类人》，湖北少儿出版社出版了《生死之约》，多达五部长篇都是他对这一问题的探索。
在《海豚人》中，作者对人性的理解超越了作为物种的人之外，可谓彻底的大同思想。在《生死之约》中，主人公表现出与中国传统文化截然相反的道德情怀：对自己占居后代人的发展空间极为愧疚，甚至不惜以死亡来让出位置。在整体上向后看，牺牲后代利益以满足前人的中国传统文化大环境下，这一思想尤显振聋发聩。
2000年2月，黑龙江出版社出版了韩松的长篇科幻小说《2066之西行漫记》这部长篇科幻虚构了2066年（文革爆发一百周年）的美国：一个闭关自守，狭隘落后的国家。作品用一个中国少年围棋手（暗示当年的乒乓外交）的眼睛描绘这个“美国”，充满了反讽和隐喻。2004年，韩松积数年琢磨的长篇巨著《红色海洋》由上海科普出版社出版。该书选择了“灭世题材”。地面被核战争毁灭后，人类只能生活在被改造的“红色海洋”里，成为海洋生物。韩松成熟老练的文笔在该作品中尽显无疑。
创作短篇科幻近二十年的绿杨，此时也推出了三部长篇科幻小说。他的太空探险题材长篇《双子星号》由河北教育出版社出版，是大陆作家在这个领域内不多见的成熟作品。他的另一部长篇科幻小说《基因幽灵》由福建少儿出版社出版，达到了作者最高的创作水平。这部作品一反作者以前的高远风格，十分贴近现实，并且大量运用了作者本人的专业知识。2004年，他的《天使终结》由海天出版社出版。